По словам Римской, в ходе расследования возбужденного ранее против Мещерякова уголовного дела были установлены факты, позволившие следствию предъявить ему обвинения в организации преступного сообщества с использованием своего служебного положения. Мещеряков обвиняется по трем эпизодам ст. 159 ч. 4 (мошенничество), по трем эпизодам статья 174.1 часть 4 (легализация (отмывание) денежных средств или иного имущества, приобретенных лицом в результате совершения им преступления), а теперь также и по статье 210 часть 3 (организация преступного сообщества лицом с использованием своего служебного положения).
Проверка, проведенная следственными органами, установила, что в течение двух последних лет возглавляемый Мещеряковым приморский региональный филиал Российского фонда федерального имущества в десятки раз занижал рыночную стоимость переданного на реализацию имущества, в итоге лишив бюджет полутора миллиардов рублей
Мещеряков был задержан 5 декабря 2007 года как один из фигурантов уголовного дела о приватизации госимущества по заведомо низким ценам. Основанием для возбуждения уголовного дела стали материалы проверки, проведенной главным управлением Генпрокуратуры РФ по ДВФО. По словам представителя прокуратуры, проверка показала, что в течение двух последних лет приморский краевой филиал Российского фонда федерального имущества занижал рыночную стоимость переданного на реализацию имущества.
В результате необоснованно назначенной переоценки стоимость реализуемого имущества уменьшалась в десятки раз от первоначальной оценки. По словам работника прокуратуры, вследствие этого в федеральный бюджет в 2006 году не поступило свыше 1 млрд рублей, в нынешнем году - свыше 500 млн рублей. 14 мая в связи с делом Мещерякова в доме губернатора Приморского края Сергея Дарькина был проведен обыск и изъят сейф с документами. 15 мая губернатор был госпитализирован в отделение кардиологии. Наказание Мещерякову может составить 20 лет лишения свободы.